1941年7月，中共中央北方局决定，冀鲁豫区与鲁西区合并，成立新的冀鲁豫区党委、军区和行署。9月，段君毅任行署副主任。1942年后，段君毅历任冀鲁豫第二、第八地委书记兼军分区政委等。
提起段君毅，在鲁西可以说是无人不知。段君毅家原本是濮县、范县交界处一个殷富之家，其父段子敬是当地贤达名流，思想开明，在和共产党人的接触中，深受影响，对革命由同情转为坚决支持。为了支持抗日武装，段子敬变卖土地，购买马匹等物资，支援抗战。
1942年，鲁西北遇到特大旱灾，群众和部队、机关的生活、供应遇到空前困难。在这种严峻的形势面前，段君毅和同志们做了大量工作，保障部队战斗力。
段君毅不愿再加重群众负担，但又不能让在抗日战场上与敌人血战的八路军战士受冻挨饿。于是，他打起了自己家的主意，瞒着父亲悄悄卖掉了70亩土地，给军队作了军饷。
1943年春节，段君毅又说服父亲，倾其所有捐出粮食，让灾民度荒。
春节过后的一天，阳光融融，十里八乡的群众感激段君毅一家帮助大家渡过难关，要庆贺一番。段君毅听说后，马上赶回去说：“我只是尽了一点义务，不能劳民伤财，盛情我领，不能庆贺。”
后来，1947年，晋冀鲁豫野战军在范县白衣阁召开团以上干部大会，刘伯承、邓小平见到段子敬，向他谈起此事，段子敬表示：“区区小事，不值一提，儿子做得对，比我强！”
工作中，段君毅经常深入基层，深入群众，他坚持实事求是，从来不搞花架子，注意调查研究，对群众体贴入微。
1942年12月，段君毅任冀鲁豫第二地委书记不久，发现地委驻地颜村铺村的土地质量差，影响农业产量。他深入调查，发现这里的土壤是上淤下沙，下小雨时上面结成硬泥皮，下大雨时水又从沙底漏掉了，保不住墒。段君毅与老农促膝长谈，了解到上淤下沙的土壤不好，上沙下淤的土壤也不好，而半沙半淤的土壤才是好土壤。
段君毅想把淤土和沙土来一次大掺和，让贫瘠的土地变成肥沃的土壤。他将自己的设想在第二地委领导班子会议上提出后，得到大家的一致赞同。
但是，1942年是华北地区特大灾荒年，党政军干部和战士们的口粮，每日每人仅半斤粮或去油的豆饼，以大家的精力、体力条件，搞大深翻土地，确实不是一件容易的事。
段君毅认为，这样的大工程，在当时的条件下，虽然困难重重，但必须克服。军队行军作战任务虽重，可是人多，挤出时间，一人挖一锨就是一大片。
于是，他带领部队搞深翻土地。段君毅每次深翻，总是挽起裤脚甩开膀子大干。干部、战士也不甘落后，你追我赶，土壤就这样一锨锨地翻挖出来了。
1949年2月,段君毅任第二野战军后勤司令部司令员兼政治委员。他采取因地制宜、上下配合、群策群力等有效措施，积极筹备渡江作战所需的船只和军需，保证“要粮有粮、要人有人、要船有船”，为完成“打过长江去，解放全中国”作出了积极贡献。
革命已经成为历史，但革命的精神永世长存。段君毅一生革命，一生战斗，他们父子齐上阵毁家纾难为革命的故事，至今读来仍令人动容。
